E3Switch DE3 Instrukcja Użytkownika Strona 56

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I Nachweis der korrekten Faltung der getesteten Rho-Proteine
Bevor Aussagen darüber gemacht werden können, ob ein rekombinantes Protein Substrat
eines Toxins ist, muss gewährleistet sein, dass das Protein in der korrekten Tertiärstruktur
vorliegt. Im Falle der Rho-GTPasen lässt sich aus der GTP-Bindung auf die korrekte Faltung
schließen, da nur eine korrekt gefaltete Rho-GTPase die Fähigkeit besitzt, GTP zu binden.
Für den Nachweis der GTP-Bindung wurde das radioaktiv markierte [γ−
35
S]GTP verwendet.
[γ−
35
S]GTP wird nicht durch die Rho-GTPasen hydrolysiert, so dass die GTP-Bindung
unabhängig von der intrinsischen GTPase-Aktivität gemessen werden kann.
Die Rho-GTPasen tauschen während der Inkubation mit [γ−
35
S]GTP kontinuierlich GDP
gegen GTP aus, wobei sie unterschiedliche Austauschraten aufweisen. Es resultiert eine
Beladung der Proteine mit [γ−
35
S]GTP, die zu mehreren Zeitpunkten anhand der
Radioaktivität gemessen wird.
In Abb. D1 ist beispielhaft für alle getesteten Rho-GTPasen die [γ−
35
S]GTP-Beladung von
RhoA, Cdc42, Rac1 und RhoG dargestellt. Es ist zu erkennen, dass die Rho-GTPasen jeweils
unterschiedliche GTP-Beladungsraten aufweisen. RhoA zeigt die schnellste [γ−
35
S]GTP-
Bindung. Auch die Mutanten der Rho-GTPasen wurden auf ihre [γ−
35
S]GTP-
Bindungsfähigkeit getestet. Alle getesteten GTPasen waren in der Lage, [γ−
35
S]GTP zu
binden.
Abb. D1: Messung der GTP-
Bindung
Gezeigt ist die [γ−
35
S]GTP-
Beladung der Rho-
GTPasen RhoA, Cdc42,
Rac1 und RhoG zu
verschiedenen Zeit-
punkten, gemessen in
Cpm (counts per minute).
Zeit (min)
0 20 40 60 80 100
Cpm
0
2000
4000
6000
8000
10000
12000
14000
Zeit (min)
0 20 40 60 80 100
Cpm
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4000
6000
8000
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RhoA
Cdc42
Rac1
RhoG
Zeit (min)
0 20 40 60 80 100
Cpm
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Zeit (min)
0 20 40 60 80 100
Cpm
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4000
6000
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RhoA
Cdc42
Rac1
RhoG
RhoA
Cdc42
Rac1
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