E3Switch DE3 Instrukcja Użytkownika Strona 75

  • Pobierz
  • Dodaj do moich podręczników
  • Drukuj
  • Strona
    / 94
  • Spis treści
  • BOOKMARKI
  • Oceniono. / 5. Na podstawie oceny klientów
Przeglądanie stron 74
69
I DNT und CNF1
Substratspezifität
Die Transglutaminierung der Rho-GTPasen wurde mit Hilfe des fluoreszierenden
Kosubstrates Monodansylcadaverin nachgewiesen. Es wird an das Glutamin 63 der GTPase
angehängt und kann unter UV-Licht in der Proteinbande auf dem SDS-Gel nachgewiesen
werden. Die Deamidierung der GTPase kann anhand einer Motilitätsänderung der
Proteinbande in der SDS-PAGE oder durch die Messung der Ammoniakfreisetzung während
der Reaktion nachgewiesen werden.
Die Tests der Substratspezifität von DNT und CNF1 ergaben, dass RhoG und RhoD im
Gegensatz zu den anderen getesteten GTPasen weder durch CNF1 noch durch DNT
transglutaminiert werden. Eine Besonderheit von RhoG ist, dass es zwar durch CNF1
deamidiert, aber nicht transglutaminiert wird. Diese Ergebnisse zeigen, dass CNF1 und DNT,
mit Ausnahme von RhoG, die gleiche Substratspezifität haben.
Eine Frage, die sich zur Deamidierung durch CNF1 stellt, ist, warum in den Versuchen die
Kontrollkurven, die die Ammoniakfreisetzung der Rho-GTPase ohne Toxin darstellen, auch
gering abfallen, also eine Ammoniakentstehung zeigen. Eine Ursache ließ sich nicht sicher
feststellen, aber möglicherweise entsteht in diesen Proben unspezifisch Ammoniak, z. B.
durch die Zersetzung des Proteins durch die Lichtstrahlung im Fluoreszenzspektrometer.
Aminosäuresequenzvergleich und Aminosäureaustausch
Um zu klären, welche Aminosäuren für die Substratspezifität relevant sind, wurden die
Aminosäuresequenzen der Switch-II-Regionen von RhoG, RhoD und RhoA verglichen und
nicht identische Aminosäuren ausgetauscht.
Über die Substratspezifität von CNF1 und DNT war zu Beginn der Arbeit bekannt, dass ein
Peptid von 20 Aminosäuren (As 59-78) für die Modifizierung durch CNF1, aber nicht die von
DNT, ausreicht. Innerhalb dieses Peptids sind die Aminosäuren 68 und 72 für die
Modifizierung durch CNF1 und DNT notwendig (Lerm, 1999a).
Die Versuche mit den RhoA-Mutanten ergaben, dass für die Transglutaminierung durch DNT
und CNF1 auch die Aminosäuren Glutamat 64 und Aspartat 65 von Bedeutung sind. Für die
Transglutaminierung durch DNT spielt außerdem Prolin 71 eine Rolle.
Deamidierungsversuche mit der RhoA-Mutante RhoA E64D zeigten, dass Glutamat 64 für die
Deamidierung durch CNF1 von Bedeutung ist.
Przeglądanie stron 74
1 2 ... 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 ... 93 94

Komentarze do niniejszej Instrukcji

Brak uwag